猕猴桃溃疡病菌biovar3群体MLVA分型技术的建立与应用

• 作者: 李月 杜淑凤 杨文 樊荣 王勇 赵志博 龙友华
• 来源期刊: 植物病理学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猕猴桃细菌性溃疡病 群体结构 基因组分型 MLVA 流行
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 病原学
• 页码范围: 445-455
• 页数: 11页
• 分类号: S432.42
• 语种: 中文
• DOI: 10.13926/j.cnki.apps.000295

摘要

丁香假单胞菌猕猴桃致病变种生物型3(Pseudomonas syringae pv.actinidiae biovar 3,Psa3)是猕猴桃溃疡病菌的世界流行群体,但仅在中国存在复杂的遗传多样性.开发适于Psa3群体分型的MLVA(multilocus variable-number tandem-repeat analysis)技术是探索中国Psa3起源与流行学特性的基础.本研究对7个Psa3菌株进行了全基因组测序,结合已公布的86个全基因组数据,进行比较分析发现,中国Psa3至少存在7个亚群;在各亚群间存在多态性的24个串联重复序列中,其中10个可以通过琼脂糖凝胶电泳区分开且变异指数合适,据此建立了适于Psa3的MLVA技术.采用该技术对分别来自贵州和陕西的62和9个Psa3菌株进行群体分型,分型结果与全基因组分析高度一致,证明该MLVA体系分型准确.MLVA分型结果表明:贵州主产区修文县Psa3有3个MLVA群体,其中亚群4的组内分化明显,代表最早发生的群体;而亚群1和3的结构单一,且多在新果园发现,是新传入群体.总之,本研究建立了一套可用于Psa3群体分型的MLVA技术,将有助于解析中国各猕猴桃产区Psa3群体结构,以及探索中国Psa3的起源、传播和流行学特征.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	龙友华		126	645	13.0	17.0
2	王勇		75	108	6.0	7.0
3	赵志博		6	0	0.0	0.0
4	樊荣		5	3	1.0	1.0
5	李月		7	7	2.0	2.0
6	杜淑凤		1	0	0.0	0.0
7	杨文		1	0	0.0	0.0