安徽省急性胃肠炎疫情相关GⅡ.P17-GⅡ.17基因型诺如病毒分子特征研究

• 作者: 刘敏鸿 史永林 孙永 张文艳 汪飞鹏 胡万富 葛盈露 金晶 陈晓龙
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 诺如病毒(NoVs) 急性胃肠炎 腹泻 基因型 分子进化
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 人类病毒研究论著
• 页码范围: 233-239
• 页数: 7页
• 分类号: R373.2|R511
• 语种: 中文
• DOI: 10.13242/j.cnki.bingduxuebao.003527

摘要

诺如病毒(Noroviruses,NoVs)是引起病毒性胃肠炎的重要病原体,本研究旨在对2015～2016年春季安徽部分地区暴发的急性胃肠炎(Acute gastroenteritis,AGE)疫情标本进行病原检测和分子分型,分析病原的基因特征.收集2015年3月至2016年5月9起AGE疫情流行病学信息和采集病例粪便、肛拭子样本.采用Real-time PCR检测NoVs核酸和RT-PCR扩增RdRp与VP1区基因序列,基因测序后应用BLAST比对和NoVs在线分型工具分析结果.7起疫情发生在中、小学校(77.78％,7/9),2起疫情发生在乡镇,发病人数中位数为6人,男女发病比例为1.41∶1,临床表现主要以恶心、呕吐/腹泻、腹痛为主.77份临床病例样本中检出66份NoVs核酸阳性,基因序列测定获得76条序列,39条序列为RdRp区GⅡ.P17基因型,37条序列为VP1区GⅡ.17基因型.基因进化树分析显示:2015～2016年安徽地区39条RdRp区NoVs GⅡ.P17基因型序列Cluster Ⅲ进化簇Ⅲ b分支,与2015年广东、海南、中国台湾地区参考毒株序列有较近的亲缘性关系,核苷酸同源性为99％～100％.37条VP1区NoVs GⅡ.17基因型序列都处在Cluster Ⅲ进化簇上,其中28条序列属于Ⅲ a进化分支,与山东2015年LX09株、2016年广东GZ2016-L492株、江苏zj019株、中国香港CUHK-NS-942株以及日本2015年AichiF101毒株序列有较近的亲缘性关系.新型GⅡ.P17-GⅡ.17基因型NoVs是引起2015年和2016年春季安徽部分地区AGE暴发的主要病原体,需加强病毒性胃肠炎流行病学调查与病原监测及分子分型鉴定工作.