5种文蛤属贝类线粒体基因密码子偏好性分析

• 作者: 吴杨平 张志东 张雨 曹奕 曹广勇 田镇 陈爱华 陈素华
• 来源期刊: 海洋渔业
• 学科: 生物学
• 关键词: 文蛤属 线粒体CDS序列 密码子 偏好性
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 589-595
• 页数: 7页
• 分类号: Q951
• 字数: 3319字
• 语种: 中文

摘要

为揭示文蛤属贝类线粒体基因组CDS序列密码子偏好性,采用CodonW、Excel 2007、SPSS 16.0和MEGA 5.0等软件对文蛤(Meretrix meretrix)、斧文蛤(M.lamarckii)、丽文蛤(M.lusoria)、短文蛤(M.petechialis)以及皱肋文蛤(M.lyrata)5种文蛤属贝类,并以青蛤(Cyclina sinensis)为参照进行分析.结果 表明:文蛤属贝类线粒体基因组偏爱使用U结尾的密码子,使用频率最高的是UCU,其次是ACU,而对C结尾的密码子使用频率最低.5种文蛤属贝类密码子的偏好性反映出了彼此的亲缘关系,即文蛤与短文蛤亲缘关系最近,其次是丽文蛤,与皱肋文蛤和斧文蛤的关系较远,与青蛤关系最远.