广东省三株蚊媒黄病毒的鉴定和系统进化分析

• 作者: 吴德 张欢 张欣 曹玉玺 李柏生 梁国栋 王环宇 谈琦琪
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 致倦库蚊 黄斑库蚊病毒(CTFV) 广平病毒(QBV) 系统进化分析
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 人类病毒研究论著
• 页码范围: 240-246
• 页数: 7页
• 分类号: R373.3|R511
• 语种: 中文
• DOI: 10.13242/j.cnki.bingduxuebao.003519

摘要

为了解广东省蚊媒病毒的种类和分子特征,本研究对从蚊子中分离的三株黄病毒提取病毒核酸并进行二代测序,经序列拼接和比对,基因组序列中缺失的gap通过RT-PCR进行扩增填补.用MEGA软件登录GenBank下载黄病毒代表株序列并绘制进化树,同时用ClustalW2软件与新毒株进行氨基酸同源性比对和编码框序列的分析.结果 显示利用二代测序技术获得了三株病毒基因组序列的96.35％～98.26％,并用RT-PCR成功补齐所有gap,序列比对显示其中一株与黄斑库蚊病毒核苷酸和氨基酸同源性98.51％,两株病毒与广平病毒的核苷酸同源性分别为97.30％和89.78％.三株病毒都属于黄病毒家族中的未分类黄病毒或昆虫特异性黄病毒,编码区序列中C蛋白的同源性最低,NS5的同源性最高.本研究发现的三株蚊媒黄病毒中,库蚊黄斑病毒在国内为首次鉴定;两株广平病毒核苷酸同源性存在较大差异,可能存在不同基因亚型.