筛选口腔扁平苔藓相关相关基因及生物学通路的研究

• 作者: 夏萍 隋长德 齐春华
• 来源期刊: 实用口腔医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 口腔扁平苔藓(OLP) 生物信息学 蛋白质互作网络 生物学通路
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 临床医学研究
• 页码范围: 243-248
• 页数: 6页
• 分类号: R781.5
• 字数: 3764字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-3733.2019.02.017

摘要

目的:利用生物信息学方法识别口腔扁平苔藓(OLP)发病过程中的生物学通路及关键基因或分子.方法:从GEO数据库中下载GSE38616,通过t检验结合Benjamini-Hochberg校正的方法筛选差异表达基因,并根据差异表达基因构建蛋白质互作网络,利用Cytoscape进行网络中心(Hub)节点识别,最后对差异表达基因进行富集分析.对Hub节点基因在20例OLP患者和20例健康对照者外周血中的表达进行检测.结果:在OLP与健康对照组之间共有212个差异表达基因.在构建的蛋白质网络中,所识别的Hub节点为GNB2L1,其在OLP患者外周血的表达显著高于健康对照组(P ＜0.001).富集分析结果显示,212差异表达基因富集的通路有29个.所富集的细胞生物学过程有:信号转导、免疫反应、细胞通讯,类固醇代谢、突触小泡转运等.结论:本研究所识别出来的29条通路及Hub节点GNB2L1可能在OLP发生发展中起到关键作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	齐春华	白城医学高等专科学校医学影像系	8	7	1.0	2.0
2	隋长德	白城医学高等专科学校口腔学院	7	10	2.0	3.0
3	夏萍	哈尔滨医科大学附属第二医院牙周黏膜科	2	0	0.0	0.0