黄牛LYST基因InDel检测及其与生长性状的关联分析

• 作者: 党瑞华 李世鹏 樊英智 蓝贤勇 赖振雨 邬明丽 陈宏 雷初朝 高源 黄永震
• 来源期刊: 家畜生态学报
• 学科: 农学
• 关键词: 黄牛 LYST基因 插入缺失 生长性状 关联分析
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 科学研究
• 页码范围: 21-26
• 页数: 6页
• 分类号: S811.5
• 字数: 3884字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-1182.2019.02.004

摘要

以LYST基因作为候选基因,基于GeneBank提供的序列,以鲁西牛、南阳牛、秦川牛、郏县红牛4个品种共计602个个体为试验材料,利用DNA池测序结合聚丙烯酰胺凝胶电泳对L YST基因的插入缺失(InDel)进行探索验证,并对不同个体进行基因分型,再结合体尺数据分析不同基因型与生长性状的关系.结果表明:(1)黄牛L YST基因的第44内含子上检测到一段InDel,片段长度为22 bp;(2)LYST基因内含子区P2 InDel突变位点在郏县红牛、秦川牛、鲁西牛群体中均存在Ⅱ、ID、DD共3种基因型,而在南阳牛群体中仅存在野生纯合基因型DD和杂合子ID两种基因型,无Ⅱ基因型存在;(3)LYST基因第28号内含子区InDel位点多态性与郏县红牛的体高、胸围、体重、重高比及体躯指数之间存在显著相关性,可以作为候选分子标记用于郏县红牛分子标记辅助选择.结论:本研究在LYST基因第28内含子发现一个能显著影响郏县红牛生长性状的22 bp插入突变,该突变可作为郏县红牛生长性状的潜在分子标记.