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犏牛雄性不育相关lncRNA的鉴定与分析
犏牛雄性不育相关lncRNA的鉴定与分析
作者:
李键
杨显英
熊显荣
王斌
王艳
阿果约达
韩杰
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
牦牛
犏牛
雄性不育
转录组
lncRNA
摘要:
旨在分析成年健康牦牛和犏牛(3~4岁)睾丸组织中长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)的表达谱,从而探究lncRNA与犏牛雄性不育机制的关联性,为解释犏牛雄性不育的机理提供理论依据.采集成年(3~4岁)健康牦牛、犏牛各3头的睾丸组织,构建cDNA文库后进行高通量测序,筛选出差异的lncRNA,通过对差异显著的lncRNA与mRNA位置关系以及结合能的判定预测顺式作用(cis)和反式作用(tran)的靶基因,并进行GO、KEGG功能分析.结果表明,共得到牦牛和犏牛候选lncRNA转录本分别为20 363和24 133个,两个文库筛选出6 178个显著差异lncRNA,其中有2 470个在犏牛睾丸组织与牦牛比较上调,3 708个下调.筛选得到差异显著lncRNA的候选靶基因2 676个,这些基因参与58个功能分类,共涉及306条通路;其中主要富集的通路包括轴突指导、内吞、Hedgehog等信号通路.综上表明,部分lncRNA介导的靶基因PTGDS、IGF2、MEST、GLIS3、NOTCH2、HOXA10、HOXA 11与犏牛雄性不育相关,lncRNA在犏牛的生殖发育中对其雄性不育具有重要的调控作用.利用RNA-Seq技术筛选出成年牦牛和犏牛睾丸组织lncRNA,并进行差异分析,为探讨犏牛雄性不育的机制提供更完善的转录组数据.
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文献信息
篇名
犏牛雄性不育相关lncRNA的鉴定与分析
来源期刊
畜牧兽医学报
学科
农学
关键词
牦牛
犏牛
雄性不育
转录组
lncRNA
年,卷(期)
2019,(3)
所属期刊栏目
生物技术与繁殖
研究方向
页码范围
551-561
页数
11页
分类号
S823.8+5.2
字数
6983字
语种
中文
DOI
10.11843/j.issn.0366-6964.2019.03.010
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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犏牛
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转录组
lncRNA
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
畜牧兽医学报
主办单位:
中国畜牧兽医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0366-6964
CN:
11-1985/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区圆明园西路2号
邮发代号:
82-453
创刊时间:
1956
语种:
chi
出版文献量(篇)
5501
总下载数(次)
6
总被引数(次)
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