miR-125a/125b基因家族进化分析及其在猪睾丸组织中的表达变化

• 作者: 冉茂良 彭馥芝 罗荟 翁波 陈斌 高虎
• 来源期刊: 经济动物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 miR-125a/125b 进化 定量表达
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 94-101,106
• 页数: 9页
• 分类号: Q786|S828.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.13326/j.jea.2018.1251

摘要

采用生物学信息方法在miRBase中搜索动物miR-125a/125b基因家族序列,利用Ensembl数据库信息确定miR-125a/125b在基因组中的位置,采用MEGA 5.0构建miR-125a/125b家族的系统进化树,并利用qRT-PCR检测miR-125a和miR-125b在沙子岭猪睾丸组织不同发育时期(D1、D30、D60、D90、D120、D150、D180)的表达变化.结果在miRBase数据库检索29个物种共58条miR-125家族序列,分布广泛,且有高度的保守性,除一个位于内含子区,两个位于外显子区,其余miR-125a/125b位于基因间隔区,在进化过程中,同种物种的进化方向具有高度的一致性,进化速度也有所不同.qRT-PCR检测结果显示,miR-125a/125b在沙子岭猪睾丸组织中不同发育时期的具有相同的趋势,即出生后其表达水平缓慢升高,保育期开始降低,性成熟期又开始呈现升高趋势,随着体成熟表达量开始降低.本研究结果为进一步探明miR-125a/125b基因家族在猪睾丸组织中的功能及作用机制奠定基础.