松树蜂毒腺转录组分析

• 作者: 任利利 敖特根 王明 王立祥 石娟 高成龙
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 松树蜂 毒腺 转录组 数据库 嗅觉相关基因 漆酶
• 年，卷（期）: 2019,（9）
• 所属期刊栏目: 生理与生化
• 页码范围: 1038-1047
• 页数: 10页
• 分类号: Q966
• 语种: 中文
• DOI: 10.16380/j.kcxb.2019.09.004

摘要

[目的]构建入侵种松树蜂Sirex noctilio毒腺转录组数据库,筛选并分析松树蜂毒腺基因数据.[方法]采用新一代高通量测序平台Illumina HiSeqTM 4000对松树蜂雌成虫毒腺进行转录组测序、数据组装和生物信息学分析.[结果]共获得12.7 Gb松树蜂雌成虫毒腺有效转录组数据,并组装到37 098条unigenes,平均长度968 bp,N50长度为2 364 bp.将所得的unigenes数据使用BlastX与各大数据库比对,共注释到13 515条unigenes,并且在NR数据库中注释的unigenes最多,共11 108条(占总数的29.94％),其中相似基因占比最高的物种为丽蝇蛹集金小蜂Nasonia vitripennis,达815条(占总数的7.29％).在GO数据库中注释到5 726条unigenes,根据功能被分为生物学进程、细胞组分和分子功能3大类63个亚类.KEGG代谢通路分析表明,7 602条unigenes注释到357个代谢通路.根据基因注释信息进一步筛选到43条嗅觉相关基因,包括嗅觉受体(odorant receptor,Or)基因25条、化学感受蛋白(chemosensory protein,CSP)基因10条、离子型受体(ionotropic receptor,IR)基因5条和气味结合蛋白(odorant binding protein,OBP)基因3条.此外,还筛选出11条漆酶基因,包括漆酶1(laccase1,LAC1)基因5条、漆酶2(laccase2,LAC2)基因4条、漆酶4(laccase4,LAC4)基因1条和漆酶9(laccase9,LAC9)基因1条,且其中1条LAC2基因在所有被注释的基因中表达量最高(FPKM值=21 126).[结论]本研究获得的松树蜂毒腺转录组数据为松树蜂毒液组分的鉴定和生物学功能的研究奠定了一定的理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王明	北京林业大学林木有害生物防治北京市重点实验室	4	20	2.0	4.0
2	石娟	北京林业大学林木有害生物防治北京市重点实验室	67	510	14.0	20.0
3	王立祥	北京林业大学林木有害生物防治北京市重点实验室	4	15	2.0	3.0
4	任利利	北京林业大学林木有害生物防治北京市重点实验室	28	87	5.0	6.0
5	高成龙	北京林业大学林木有害生物防治北京市重点实验室	6	12	3.0	3.0