太岁表层组织DNA提取前处理对细菌结构的影响

• 作者: 李慧 李聪 王世清 王朝江 高春燕
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 生物学
• 关键词: 太岁 表层组织 DNA提取前处理 细菌菌群结构
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 463-469
• 页数: 7页
• 分类号: Q938
• 语种: 中文
• DOI: 10.16519/j.cnki.1004-311x.2019.05.0077

摘要

[目的]比较不同DNA提取前处理方法对太岁表层组织细菌结构的影响.[方法]设水浸提(SO1)、浸提后热溶解(SO2)、直接热溶解(SO3)与微孔过滤结合的3种处理法,高通量测序.[结果]SO1、SO2、SO3的Shannon指数均接近4.44,OTU数目均接近1 677个,共有OTU 807个,序列占比95.65％.所含细菌在各分类水平上数目相近,各涉及约20个门、200多个属,优势类群集中在未分类属(unclassified)、假单胞菌属(Pseudomonas)、不动杆菌属(Acinetobacter)和Povalibacter4个属,占比之和超过了60％.除未分类属外的三个属,均各有一种超高占比OTU支撑.假单菌属占比最高,各处理均为21％左右.[结论]3种前处理方法测得的细菌菌群结构,均表明太岁表层组织中细菌种类多,分布不平衡,假单胞菌属是占比21％的最优势属.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高春燕		36	75	5.0	7.0
2	王朝江		47	135	6.0	10.0
3	李慧		15	6	2.0	2.0
4	王世清		4	1	1.0	1.0
5	李聪		2	0	0.0	0.0