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大豆JAZ基因家族的鉴定及其对疫霉胁迫的响应
大豆JAZ基因家族的鉴定及其对疫霉胁迫的响应
作者:
卜远鹏
沈甲诚
赵晋铭
邓肃霜
邢邯
郭娜
黄建丽
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
大豆
JAZ基因家族
生物信息学
大豆疫霉
qRT-PCR
摘要:
JAZ(Jasmonate ZIM-domain)蛋白是茉莉酸信号途径中重要的负调控因子,对植物的防御反应具有重要意义.然而,鲜有关于大豆JAZ基因的报道,为了揭示大豆中JAZ基因家族的特征和潜在功能,本研究利用生物信息学方法从大豆基因组中鉴定到24个JAZ基因,分别命名为GmJAZ1~GmJAZ24,并对这24个基因进行基因结构分析、保守基序分析、系统进化树构建、染色体定位、启动子顺式作用元件分析以及大豆疫霉菌胁迫下的响应分析.结果 表明:(1)24个GmJAZs基因不均匀的分布在大豆的14条染色体上,其中9号染色体上分布的数目最多,为4个;(2)大豆、拟南芥和水稻的JAZ基因家族可分成5个亚组(C1~C5),其中大豆与拟南芥的JAZ基因亲缘关系最近;(3)该家族成员大多含有响应茉莉酸和脱落酸等激素的顺式作用元件,少数含有响应逆境胁迫的顺式作用元件;(4)大豆疫霉菌处理后,C4亚组成员显著上调表达,C1亚组成员微弱上调,而C2、C3和C5亚组成员下调表达,表明大豆JAZ基因家族成员对大豆疫霉菌的胁迫具有不同的响应模式.
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篇名
大豆JAZ基因家族的鉴定及其对疫霉胁迫的响应
来源期刊
大豆科学
学科
关键词
大豆
JAZ基因家族
生物信息学
大豆疫霉
qRT-PCR
年,卷(期)
2019,(6)
所属期刊栏目
遗传育种·分子生物学
研究方向
页码范围
868-878
页数
11页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.11861/j.issn.1000-9841.2019.06.0868
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研究主题发展历程
节点文献
大豆
JAZ基因家族
生物信息学
大豆疫霉
qRT-PCR
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
大豆科学
主办单位:
黑龙江省农业科学院
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-9841
CN:
23-1227/S
开本:
大16开
出版地:
哈尔滨市南岗区学府路368号
邮发代号:
14-95
创刊时间:
1982
语种:
chi
出版文献量(篇)
3361
总下载数(次)
6
总被引数(次)
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