咖啡种质资源遗传多样性的ISSR分析

• 作者: 孙燕 林兴军 王晓阳 董云萍 闫林 黄丽芳 龙宇宙
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 咖啡 ISSR 遗传多样性 聚类分析 主坐标分析
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子生物学
• 页码范围: 491-499
• 页数: 9页
• 分类号: S571.202.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2019.03.08

摘要

[目的]对我国收集保存的咖啡种质资源进行遗传多样性分析,为咖啡种质资源的收集、保存、鉴定、创新及有效利用提供理论参考.[方法]从哥伦比亚大学(UBC Primer Set#9)公布的100个ISSR引物序列中筛选出多态性好、扩增条带清晰且重复性好的引物,利用其对72份咖啡种质材料进行扩增,对电泳图谱进行统计分析,并利用NT-SYSpc 2.1计算遗传相似系数和遗传距离.根据非加权算术平均法(UPGMA)进行聚类分析,并进行主坐标分析.[结果]筛选出的19条引物共扩增出153条条带,其中多态性条带数为128条,占总条带数的83.7％;72份咖啡种质材料间的遗传相似系数为0.4531～0.9609,平均为0.6567;遗传距离为0.0351～1.0951,平均为0.4081.其中,大粒种种内遗传相似系数最大(0.9297～0.9531),遗传距离最小(0.0445～0.0669);中粒种种内遗传相似系数最小(0.5781～0.8750),遗传距离最大(0.1210～0.5363).主坐标分析与聚类分析结果一致,均显示72份咖啡种质材料可分为三大类,其中3份大粒种、3份查理种及1份中粒种巴布亚新几内亚-2聚为Ⅰ类群;32份小粒种聚为聚为Ⅱ类群;除巴布亚新几内亚-2外的其他31份中粒种及1份中小粒杂交种Arabusta和1份福建咖啡共33份聚为Ⅲ类群.聚类分析结果与种质地理来源无明显相关性.[结论]咖啡种质资源各种间存在较大的遗传差异,以中粒种种内遗传多样性较丰富,以大粒种种内遗传多样性较低.利用ISSR分子标记可准确分析咖啡资源遗传多样性.