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摘要:
该研究基于MiSeq高通量测序技术对大连、 烟台、 霞浦和莆田地区养殖仿刺参(Apostichopus japonicus)肠道菌落结构进行分析.结果表明,大连、 烟台、 霞浦和莆田地区养殖仿刺参肠道测得的分类操作单元(OTUs)分别为455、542、440和242.四个样品菌群的物种丰度和优势菌种存在较大差别,其中莆田池塘养殖的仿刺参的肠道菌群比霞浦海上吊笼养殖高2倍多.烟台的仿刺参的丰富度最高,Simpson/Shannon指数达到4.78.四个产地仿刺参肠道中共检测到317个细菌种属.大连养殖仿刺参肠道的主要优势菌群为Lutibacter(10.13%),属拟杆菌门的黄杆菌科,是一种兼性厌氧菌.烟台养殖仿刺参肠道的主要优势菌群为Haliea(21.34%)和Halioglobus(12.58%).莆田养殖仿刺参肠道中乳球菌属(Lactococcus)、 芽孢杆菌属(Bacillus)所占比例较高.在霞浦养殖仿刺参肠道中Formosa含量最高,占细菌总数的比例为87.06%,其次为乳球菌属(Lac-tococcus),占细菌总数比例为7.71%.文章利用Miseq高通量测序技术对仿刺参肠道菌群结构进行分析,为今后进一步研究仿刺参肠道菌群与其摄食、 消化、 免疫等之间的关系提供了新的资料.
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文献信息
篇名 福建与山东、 辽宁养殖仿刺参肠道菌群结构的差异分析
来源期刊 渔业研究 学科 农学
关键词 Miseq高通量测序 仿刺参 肠道菌群
年,卷(期) 2019,(3) 所属期刊栏目 论文与报告
研究方向 页码范围 187-194
页数 8页 分类号 S917.4
字数 3998字 语种 中文
DOI 10.14012/j.cnki.fjsc.2019.03.002
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 陆振 福建省水产研究所福建省海洋生物增养殖与高值化利用重点实验室 4 1 1.0 1.0
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研究主题发展历程
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Miseq高通量测序
仿刺参
肠道菌群
研究起点
研究来源
研究分支
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相关学者/机构
期刊影响力
渔业研究
双月刊
1006-5601
35-1331/S
大16开
福建省厦门市东渡海山路7号
1979
chi
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1348
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