我国口岸瓜实蝇监测样本的SSR分子标记分析

• 作者: 叶军 朱雅君 李飞 王书平 蒋费涛 许佳丹
• 来源期刊: 生物安全学报
• 关键词: 瓜实蝇 转录组 微卫星标记 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 259-268
• 页数: 10页
• 字数: 6267字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1787.2019.04.005

摘要

[目的]瓜实蝇是世界性检疫害虫,被列入我国口岸常年监测计划中.本研究以检疫性有害生物瓜实蝇为研究对象,利用不同地理种群瓜实蝇的转录组发现特异性的微卫星(simple sequence repeats,SSR)序列,分析我国口岸监测的瓜实蝇样本的遗传多样性.[方法]利用生物信息学方法,对4个不同地理来源的瓜实蝇转录组进行分析,发现了特异性的SSR序列,并设计特异性引物,选用我国11个省市的49个瓜实蝇监测样本进行测试及验证,使用NTsys和Popgene 32软件进行遗传多样性分析.[结果]筛选出15对多态性较好的引物,UPGMA聚类分析显示,新疆、四川和广西种群归为一支,浙江、广东、江苏种群归为一支,上海、云南、海南、天津种群归为一支,北京种群单独聚为一支.[结论]聚类分析结果显示,11个不同省市的瓜实蝇监测样本间基因分化系数为0.6712,表明不同口岸的瓜实蝇监测样本间的遗传分化较大,可能具有不同的来源地,可为进一步开发监测样本溯源技术提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李飞	浙江大学昆虫科学研究所	60	438	12.0	20.0
2	叶军		4	9	1.0	3.0
3	朱雅君		3	0	0.0	0.0
4	蒋费涛	重庆三峡学院环境与化学工程学院	2	0	0.0	0.0
5	许佳丹		1	0	0.0	0.0
9	王书平		1	0	0.0	0.0