高通量测序结合传统方法分析4℃下鲜切菠菜的菌群变化

• 作者: 谢晶 郁杰
• 来源期刊: 食品与发酵工业
• 关键词: 鲜切菠菜 高通量测序技术 传统检测方法 菌群演替
• 年，卷（期）: 2019,（9）
• 所属期刊栏目: 生产与科研经验
• 页码范围: 183-189
• 页数: 7页
• 字数: 5774字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13995/j.cnki.11-1802/ts.019261

摘要

采用Illumina MiseqTM高通量测序技术结合传统检测方法,对4℃下贮藏的鲜切菠菜在贮藏过程中存在的腐败菌进行研究.结果 表明:在科的分类标准下,在贮存初期,假单胞菌科和肠杆菌科为优势菌科,丰度分别占比48.99％、48.62％,从菌群变化的角度来看,随着贮藏时间的推移,假单胞菌科的丰度从初始丰度的48.99％到贮藏末期的70.27％;而肠杆菌科则从初始丰度的48.62％不断递减至21.75％.此时,假单胞菌科为贮藏末期的优势菌科;在属的分类标准下,假单胞菌属、泛菌属为贮存初期的优势菌属,丰度分别占比47.84％、30.7％,欧文氏菌属、布丘氏菌为次优势菌,丰度为8.09％和4.64％;贮存中期,假单胞菌属为优势菌属,其丰度上升至58.25％,而泛菌属丰度下降至13.94％,欧文氏菌属丰度基本保持不变达8.69％、布丘氏菌属丰度小幅上升至9.73％;在贮存末期,假单胞菌属占绝对优势,丰度占比68.97％,而泛菌属丰度仅占5.4％,欧文氏菌属占比10.7％,布丘氏菌属占比4％,假单胞菌属成为优势腐败菌属.高通量检测技术和传统检测方法相比,在鉴定样品DNA组成成分时可精确定量,提高了精度,节约了时间.