河南鲁山五大温泉古细菌多样性分析

• 作者: 刘丽 张俊峰 张科 李冰洁 王瑜 郑新华
• 来源期刊: 信阳师范学院学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 温泉 古细菌 16S rDNA基因 HiSeq2500 PE250
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 基础理论研究
• 页码范围: 221-227
• 页数: 7页
• 分类号: Q913
• 字数: 4410字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-0972.2019.02.009

摘要

河南省平顶山市鲁山县有上汤、中汤、下汤、温汤和碱汤等五大温泉,采用Illumina Hisiq2500 PE250技术对鲁山五大温泉(上汤、中汤、下汤、温汤和碱汤)古细菌的16S rDNA基因V4-5变异区序列进行测序,应用Uparse、Mothur、SILVA、MUSCLE和Qiime等软件整理和统计样品序列数目和操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)数量,分析物种的丰度和多样性.上汤、中汤、温汤、下汤和碱汤分别获得87 993、67 326、44 400、48 611、48 495条有效reads,聚类为520、280、678、451、437个OUTs.古细菌分类分析表明,河南鲁山五大温泉的古细菌可以归入11个门,其中奇古菌门(Thaumarchaeota)占95.25％,是优势菌群;在属分类阶元上,上汤、中汤和温汤的优势菌属为Candidatus-N itrosocaldus;unidenti fied-Thaumarchaeota是下汤和碱汤的优势菌属.对河南鲁山五大温泉开展古细菌多样性的研究发现,温泉水中含有较高的参与氨氧化过程的奇古菌门,为后续深入研究和利用河南鲁山五大温泉水中的古细菌资源提供了基础资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李冰洁		11	12	2.0	3.0
2	郑新华		29	67	4.0	6.0
3	王瑜		21	30	4.0	4.0
4	刘丽		10	17	3.0	4.0
5	张科		10	9	2.0	2.0
6	张俊峰		16	6	1.0	1.0