翘嘴鲌胰岛素样生长因子-Ⅰ的克隆及序列分析

• 作者: 刘士力 程顺 蒋文枰 贾永义 赵金良 迟美丽 郑建波 顾志敏
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 翘嘴鲌 胰岛素样生长因子-Ⅰ基因 内含子 微卫星 序列分析
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 页码范围: 272-281
• 页数: 10页
• 分类号: Q344+.1
• 字数: 8300字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2019.034

摘要

为探讨胰岛素样生长因子-Ⅰ(Insulin like growth factor-Ⅰ, IGF-Ⅰ)对于翘嘴鲌(Culter alburnus)生长性状的影响, 对其DNA序列进行了克隆.翘嘴鲌IGF-Ⅰ全长14567 bp, 由5个外显子和4个内含子组成.其5个外显子长度分别为298、160、182、36 和1360 bp.推测的阅读框为486 bp, 编码由161个氨基酸组成的IGF-Ⅰ前体蛋白.前体肽由信号肽、成熟肽、E肽三部分组成, 其中信号肽44个氨基酸, 成熟肽70个氨基酸, E肽47个氨基酸.成熟肽由B、C、A、D四个区域组成, 其中B结构域和A结构域的保守性最高, 在这2个区域包含由 6个半胱氨酸残基形成的3个二硫键.翘嘴鲌B区域还包含保守的IGF-Ⅰ受体识别序列(PheB23-TyrB24-PheB25). E肽的长度表明翘嘴鲌IGF-Ⅰ属Ea-2型.同源性分析表明翘嘴鲌与鲤科鱼类的IGF-Ⅰ编码氨基酸同源性较高, 为94％-100％, 但在聚类分析中翘嘴鲌并不是首先和鲌亚科的鱼类聚集在一起.Real-time qPCR组织特异性表达结果显示IGF-Ⅰ mRNA在肝脏组织中的表达量最高, 脾、心脏、精巢、脑次之, 肾、鳃、胃和卵巢中表达量较低.翘嘴鲌IGF-Ⅰ基因4个内含子长度分别为1170、9364、251 和1746 bp.相对外显子来说, 种间内含子变异较大, 其中第三内含子变异最大.翘嘴鲌IGF-Ⅰ基因中包含6个微卫星, (GATG)5AATAT (ATAG)11位于第一内含子中, (CT)8、(TTA)5、(AC)13、(TG)12和(ATT)5位于第二内含子中.其中4个微卫星位点具有多态性, 将它们在120尾同塘养殖的翘嘴鲌中进行基因型与生长性状的关联性分析, 均未达到显著水平(P>0.05).结果为进一步研究该基因的表达、功能及其转录调控特征奠定了分子基础.