华支睾吸虫一氧化氮合酶相互作用蛋白基因的生物信息学分析

• 作者: 余新炳 许青霞 边萌
• 来源期刊: 热带医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 华支睾吸虫 一氧化氮合酶相互作用蛋白 基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 实验研究论著
• 页码范围: 945-948,978
• 页数: 5页
• 分类号: R532.23
• 语种: 中文

摘要

目的 分析和预测华支睾吸虫一氧化氮合酶相互作用蛋白(CsNOSIP)基因序列结构和功能特征及其编码蛋白的理化性质,预测该基因的生物学意义.方法 利用生物信息学方法(Vector NTI、InterProScan、SignalP和SecretomeP等相关软件)对华支睾吸虫一氧化氮合酶相互作用蛋白基因及相应氨基酸序列的同源性、理化性质、保守结构域、信号肽、亲水性/疏水性、B细胞表位进行预测分析.结果 华支睾吸虫一氧化氮合酶相互作用蛋白基因的开放阅读框包含867 bp,编码288个氨基酸,理论分子质量为35 Mr,等电点为9.16.SignalP和SecretomeP分析结果显示华支睾吸虫一氧化氮合酶相互作用蛋白为非经典途径分泌蛋白;InterProScan分析结果显示,华支睾吸虫一氧化氮合酶相互作用蛋白特征性结构域位于第45～76位,第211～267位和第1～289位氨基酸之间.在该基因的氨基酸序列中,共发现7个B细胞表位.结论 利用生物信息学知识和各种分析软件对CsNOSIP所编码的cDNA序列及理论蛋白质的理化性质、结构和功能域等进行预测和分析,能够为开展CsNOSIP的表达及其功能研究提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	余新炳	中山大学中山医学院寄生虫学教研室	201	1352	17.0	28.0
5	许青霞	郑州大学附属肿瘤医院检验科	33	39	3.0	4.0
9	边萌	郑州大学附属肿瘤医院检验科	1	1	1.0	1.0