大黄鱼雌雄性腺长链非编码RNA的挖掘与差异分析

• 作者: 李完波 王伟佳 王志勇 韩兆方
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大黄鱼 性腺 lncRNA 性别分化
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 852-860
• 页数: 9页
• 分类号: S917
• 字数: 4828字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2019.19087

摘要

为探究长链非编码RNA在大黄鱼性腺发育与分化中的作用,从雌雄各3尾大黄鱼(Larimichthys crocea)的性腺中提取总RNA,进行去除rRNA的链特异性转录组建库和二代测序.将测序数据比对到大黄鱼参考基因组,经比对、组装共得到来自31675个基因的66088个转录本,严格筛选得到来自3984个基因位点的5162条lncRNA.进一步分析获得了在大黄鱼雌雄性腺中差异表达的mRNA 9341个,lncRNA 2782个,高度相关的lncRNA-mRNA对1227个;有多个lncRNA靶向已知的性别分化和发育相关基因,其中lncRNA MSTRG.24346与大黄鱼的性别决定候选基因dmrt1距离相近,且相关性极显著.该研究表明lncRNA可能在大黄鱼性别分化中起到重要作用,值得深入研究阐明机制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王志勇	集美大学农业农村部东海海水健康养殖重点实验室	86	1707	22.0	39.0
2	王伟佳	集美大学农业农村部东海海水健康养殖重点实验室	1	1	1.0	1.0
6	韩兆方	集美大学农业农村部东海海水健康养殖重点实验室	2	2	1.0	1.0
7	李完波	青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室	1	1	1.0	1.0