三唑磷对斑马鱼H19和Sox2OT基因表达调控的影响

• 作者: 乔嘉凯 张丹燕 杜羽亭 贾龙略 郭江峰 黄涵年
• 来源期刊: 农药学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 三唑磷 斑马鱼 长链非编码RNA-微RNA-信使RNA 生物信息学 基因表达 污染监测
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 291-299
• 页数: 9页
• 分类号: Q786|S481.1|S482.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.16801/j.issn.1008-7303.2019.0047

摘要

长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA)是指长度大于200 nt且不具有编码蛋白质功能的一类RNA分子.当生物体暴露于环境污染物时,其lncRNA通常会异常表达,并与癌症等疾病的发生相关.采用亚致死浓度的三唑磷处理斑马鱼后,利用人源基因芯片初步筛选出了异常表达的斑马鱼lncRNA,并通过生物信息学软件预测了与lncRNA相互作用的微RNA(micro RNA,miRNA)及其靶基因,最后通过实时荧光定量PCR验证了该miRNA及其靶基因在斑马鱼中的表达,从而构建起了长链非编码RNA-微RNA-信使RNA (lncRNA-miRNA-mRNA)的调控网络.荧光定量PCR检测结果表明:与空白对照组相比,经三唑磷处理后,斑马鱼lncRNA Sox2OT基因的表达下调了35％;lncRNA H19基因的表达上调了1.41倍,而与其可能存在相互作用的dre-let-7c基因的表达则下调了78％,同时dre-let-7c的靶基因ddx18的表达上调了2.11倍;差异均达显著水平(P＜0.05).据此推测,在三唑磷的作用下,lncRNA H19可能作为靶基因ddx 18的竞争性内源RNA而与dre-let-7c发生相互作用,从而调控靶基因ddx18的表达.因此,lncRNA H19、dre-let-7c及ddx18都有可能作为生物标志物用于监测三唑磷对环境和生物体的影响.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭江峰	浙江理工大学生命科学与医药学院生物工程研究所	52	222	8.0	13.0
2	黄涵年	浙江经贸职业技术学院应用工程系	11	26	3.0	5.0
3	贾龙略	浙江理工大学生命科学与医药学院生物工程研究所	4	6	2.0	2.0
4	张丹燕	浙江理工大学生命科学与医药学院生物工程研究所	4	3	1.0	1.0
5	乔嘉凯	浙江理工大学生命科学与医药学院生物工程研究所	2	0	0.0	0.0
6	杜羽亭	浙江理工大学生命科学与医药学院生物工程研究所	1	0	0.0	0.0