基于高通量测序技术分析番鸭呼肠孤病毒感染雏番鸭肠道转录组学的变化

• 作者: 吴异健 吴晓平 李健 李鸿文 王全溪 骆钰 黄一帆 黄诗杭
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 农学
• 关键词: 番鸭呼肠孤病毒(MDRV) 黏膜免疫 转录组 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 动物病毒研究论著
• 页码范围: 278-287
• 页数: 10页
• 分类号: S852.65|S855.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.13242/j.cnki.bingduxuebao.003502

摘要

番鸭呼肠孤病毒(Muscovy duck reovirus,MDRV)感染雏番鸭可导致肠道黏膜受损,造成肠黏膜免疫功能低下甚至丧失.为寻找番鸭呼肠孤病毒感染雏番鸭肠道组织免疫相关的差异表达基因,本研究建立番鸭呼肠孤病毒自然发病模型,在感染后3d、6d、21d采集同居感染组和对照组试验雏番鸭的空肠,对其进行高通量测序,对差异表达基因进行GO功能分类和KEGG数据库分析.结果 显示,感染后3d、6d和21d分别筛选出2 297、5860和3 721个差异表达基因;GO分子功能结果显示,免疫相关差异表达基因主要和免疫球蛋白的产生、T细胞活化和单核细胞趋化性等有关;KEGG通路富集结果显示,差异表达基因主要涉及在吞噬体、细胞溶质DNA传感途径、细胞因子-细胞因子受体相互作用、Toll样受体信号通路、Jak-STAT信号通路和RIG-Ⅰ受体信号通路;荧光定量RT-PCR对差异表达基因进行验证,其结果与转录组学结果基本一致.本研究为进一步阐明MDRV感染导致雏番鸭肠道损伤和黏膜免疫抑制的机制奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王全溪		82	817	14.0	27.0
2	黄一帆		135	1268	20.0	28.0
3	吴异健		42	134	8.0	10.0
4	李健		58	329	10.0	15.0
5	吴晓平		12	4	1.0	1.0
6	李鸿文		5	0	0.0	0.0
7	黄诗杭		2	0	0.0	0.0
8	骆钰		7	0	0.0	0.0