基于线粒体COⅠ和16SrRNA基因序列比较分析东海带鱼群体遗传多样性

• 作者: 卞光明 柴学军 王娜泠 王跃斌 胡则辉 胡成硕
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 东海带鱼 COⅠ 16S rRNA 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 页码范围: 282-290
• 页数: 9页
• 分类号: Q346+.5
• 字数: 5933字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2019.035

摘要

测定了东海带鱼(Trichiurus lepturus Linnaeus)三个群体(命名为A: 122°32′E 29°55′N、B: 123°30′E 26°75N; C: 124°24′E 27°26′N)72个个体的线粒体DNA16S rRNA和COⅠ基因序列,通过单基因序列和联合序列分析, 研究了东海带鱼群体的遗传变异情况.分别得到1130 bp的COⅠ基因序列片段和554 bp的16S rRNA序列片段, 其中COⅠ基因片段的T、C、A、G含量分别为29.0％、28.9％、24.4％和17.7％; 16S rRNA基因片段的T、C、A、G含量分别为22.7％、27.6％、28.0％和21.7％.基于线粒体16S rRNA、COⅠ和16S+COⅠ基因序列分析, 72个个体中分别确定43个, 8个和49个单倍型, 存在单倍型共享现象.群体的单倍型多样性指数为 0.9766-0.9992, 显示了群体内的单倍型较为丰富.3个群体间各序列平均核苷酸差异数(K)在5.111-9.024和 0.0045-0.0076, 核苷酸多样性指数(π)为0.0048-0.0084, 显示不同带鱼群体遗传多态性丰富.使用邻接法构建的分子进化树揭示同一群体内大部分个体聚在一起.分析结果表明, 群体A遗传背景比群体B、群体C较为丰富, 群体内部个体差异大于群体间差异, 群体间基因交流频率较高, 遗传分化不明显, 初步判定东海带鱼3个群体的遗传多样性偏低.