半滑舌鳎有效群体大小估计

• 作者: 崔瑜 李恒德 王伟峰 王悦玲 王焕岭 蒋丽
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 半滑舌鳎 简化基因组测序(2b-RAD) 连锁不平衡 有效群体大小
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 页码范围: 997-1004
• 页数: 8页
• 分类号: Q347|S965.3
• 字数: 4730字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20171011000

摘要

为了解半滑舌鳎当前的群体遗传结构,探究半滑舌鳎有效群体大小(Ne)发展趋势及现状,实验通过性别特异性分子标记随机鉴定了800尾半滑舌鳎的遗传性别,选取297个遗传雌性半滑舌鳎样本进行简化基因组测序(2b-RAD),获得了64 416个可用SNP标记,利用这些标记进行全基因组范围的连锁不平衡分析得到各染色体上连锁不平衡分布;根据标记间不同物理间距进行半滑舌鳎有效群体大小的估计,初步了解各历史世代下有效群体规模;通过选择0.1、0.2、0.5、1.0、2.0、5.0、10.0 Mb等7个不同染色体片段大小反映出半滑舌鳎群体遗传结构经过自然与人工共同选择的历史发展趋势.结果 显示,半滑舌鳎有效群体大小随其连锁不平衡程度衰减而呈连续下降趋势,至2世代前其有效群体大小仅为29尾左右.