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摘要:
谷胱甘肽转移酶(glutathione-S-transferase, GST)是一类重要的多功能超家族酶,普遍存在于植物体中,作为配体或结合蛋白,在调控植物的生长发育、解除外界毒素作用过程起到重要作用.为全面了解花生GSTs基因家族的结构特性,本论文通过生物信息分析技术对花生GST基因家族进行全基因组鉴定和表达特性分析,结果表明,在花生全基因组中一共有163个GSTs基因,其中A组基因中含有76个,B组基因中含有87个.基因结构和发育进化树将花生GST基因分为6类:Tau、Theta、Lamda、EF1Bγ、Phi和DHAR,花生GST家族基因结构进化相对保守,但各基因的内含子数量及长度有较大差异,其中EK5R9的外显子数最多,达19个;而K7JNV的内含子最长,约18 kb. MEME分析发现,花生GST家族基因中存在9个保守域,各基因中的保守结构域为6~8个不等.染色体定位显示,花生GSTs家族基因在花生A、B染色体组上呈不均匀分布,在A02、A03、A07、A09、B02、B03、B05、B08和B09号染色体上存在1~2个基因簇.表达分析发现,只有80个花生GST基因具有组织表达差异,其中6个的组织表达有极显著差异.本研究为GSTs基因的功能研究及花生抗逆性提高提供了理论依据.
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篇名 花生GSTs家族基因的全基因组分析
来源期刊 花生学报 学科 农学
关键词 花生 谷胱甘肽转移酶 基因家族 全基因组分析
年,卷(期) 2019,(4) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 25-34
页数 10页 分类号 Q343.1+7|S565.2
字数 5297字 语种 中文
DOI 10.14001/j.issn.1002-4093.2019.04.005
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山东省青岛市李沧区浮山路126号山东省花生研究所
1972
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