高粱糖转运蛋白基因家族全基因组鉴定、分类及表达分析

• 作者: 刘洋 安东升 徐志军 徐磊
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 高粱 STP 基因家族 系统进化 表达分析
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·生物技术
• 页码范围: 65-73
• 页数: 9页
• 分类号: Q78|S514.03
• 字数: 6942字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.201751467

摘要

糖转运蛋白(Sugar transporter protein,STP)基因家族在植物单糖分配中具有重要作用,并参与植物生长和发育过程中的许多代谢进程.为探究STP基因家族在高粱生长发育中的潜在功能,对高粱STP基因家族进行了全基因组鉴定、分类和组织表达分析.从高粱基因组中共鉴定出19个包含Sugar_tr结构域的STP基因,不均匀分布于9条染色体上,其中有4个基因位于基因组重复区.19个SbSTP根据其系统发育特征可以分为5组,同组的家族成员具有相同或类似的基序类型和排列顺序,但在内含子和外显子数量上存在较大差异.RNA-Seq数据分析显示,至少有18个SbSTP基因可以表达,不同的基因在不同的组织中具有不同的表达模式,其中SbSTP11特异性在花中表达,Sb-STP4、SbSTP5在特定组织中受ABA和PEG的诱导表达.为进一步研究单个SbSTP基因的生物学功能,挖掘SbSTP家族的应用潜力奠定了基础.