拟南芥LBD15互作蛋白的筛选和鉴定

• 作者: 孙旭东 徐慧妮 杨永平 郭兆来
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 拟南芥 LBD15 酵母双杂交系统 蛋白互作
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·生物技术
• 页码范围: 52-58
• 页数: 7页
• 分类号: S54.03
• 字数: 4274字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.201751326

摘要

为了进一步挖掘拟南芥LBD逆境胁迫响应基因在植物非生物逆境胁迫应答中的作用,探究拟南芥逆境胁迫响应机理,将前期筛选到的LBD15基因构建到pGBKT7酵母表达载体上,筛选与LBD15互作的蛋白.利用酵母双杂交技术筛选了拟南芥全长均一化的酵母文库,在本次筛库试验中,146个样有107个测出序列,通过NCBI Blast分析,其中有96个获得了基因号,占总数的87.9％.根据基因号进行分类,得到了48个蛋白,在筛选到的48个蛋白中有59％的蛋白都是有重复的.然后把基因号通过网站TAIR(www.arabidopsis.org/index.jsp)查找其蛋白序列,通过亚细胞定位预测网站(http://cello.life.nctu.edu.tw/)分析其亚细胞定位,定位分析结果表明,这些蛋白主要定位于叶绿体、细胞质和细胞核.利用Blast2GO进行Gene Ontology注释显示互作蛋白共参与了14个生物过程,包括细胞过程、代谢过程、刺激响应、生物过程的调控、单组织和多组织过程及发育进程调控等.对得到的可能互作蛋白随机挑选了5个进行了互作蛋白的分离和回复验证,结果发现,AP19蛋白及其他一些蛋白的菌落能够在营养缺陷型的平板上正常生长,进一步证实了其为互作蛋白.酵母双杂交文库的成功筛选为进一步研究拟南芥LBD15的分子作用机制奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨永平	中国科学院昆明植物研究所	32	396	10.0	19.0
2	徐慧妮	昆明理工大学生命科学与技术学院	19	122	8.0	10.0
3	郭兆来	昆明理工大学生命科学与技术学院	3	3	1.0	1.0
5	孙旭东	中国科学院昆明植物研究所	4	17	2.0	4.0