基于Oncomine和TCGA数据挖掘分析MTERF2在胰腺癌中的表达及临床意义

• 作者: 孙美涛 张态 张若鹏 李彬 梅雯 熊伟 王唯斯
• 来源期刊: 生物技术通讯
• 学科: 医学
• 关键词: 线粒体转录终止因子2(MTERF2) 胰腺癌 Oncomine数据库 癌症基因组图谱(TCGA) 数据挖掘
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 163-169
• 页数: 7页
• 分类号: Q811.4|R735.9
• 字数: 3917字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0002.2019.02.004

摘要

目的:探究人线粒体转录终止因子2(MTERF2)在胰腺癌中的表达及临床意义.方法:检索Oncomine数据库中的MTERF2信息,对其在胰腺癌组织和正常胰腺组织中的表达进行荟萃分析;从美国癌症基因组图谱(TCGA)中下载胰腺癌数据集MTERF2 RNA Seq V2数据及临床病理资料;利用R 2.15.3软件分析MTERF2表达量与临床病理参数的相关性及预后;利用Kaplan-Meier生存函数分析MTERF2表达量和胰腺癌患者预后的关联.结果:Oncomine数据库中共收集了586个不同类型的研究结果,其中关于MTERF2表达有统计学差异的研究有58个,MTERF2表达增高的研究有26个,表达减低的研究有32个.共有9项研究涉及MTERF2在胰腺癌组织和正常组织中的表达,包括226例临床样本,与对照组相比,MTERF2在胰腺癌中低表达(P=7.34× 10-6).TCGA胰腺癌数据集中共收集179例具有临床病理参数的病例及其对应的MTERF2 mRNA表达量.剔除病理参数不详或不完整的病例,利用R 2.15.3软件分析发现,MTERF2 mRNA表达量与胰腺癌患者T分期、M分期、癌症类型及原发部位存在显著相关(均P＜0.05),而与患者的年龄、性别、N分期、AJCC病理分期、等级、组织学类型及饮酒吏无显著相关(均P＞0.05).Kaplan-Meier生存分析发现,胰腺癌患者MTERF2的表达水平与总生存率(OS)无显著相关性(P＞0.05),而与无病生存率(DFS)显著相关(P＜0.001).结论:Oncomine和TCGA数据挖掘显示,人MTERF2在胰腺癌组织中低表达,且MTERF2表达量与胰腺癌患者总生存率无显著相关性,与无病生存率有显著相关性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李彬	大理大学基础医学院	9	2	1.0	1.0
2	熊伟	大理大学基础医学院	54	97	6.0	8.0
3	孙美涛	大理大学基础医学院	27	57	4.0	6.0
4	梅雯	大理大学基础医学院	26	43	3.0	6.0
5	王唯斯	大理大学基础医学院	23	8	2.0	2.0
6	张若鹏		50	41	3.0	5.0
7	张态	大理大学公共卫生学院	6	5	2.0	2.0