砂藓RcPIP2基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 张梅娟 徐红红 沙伟 钱朋智 马天意
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 砂藓 RcPIP2 水通道蛋白 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·生物技术
• 页码范围: 30-36
• 页数: 7页
• 分类号: Q78
• 字数: 4207字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.201751698

摘要

水通道蛋白是一类较小的跨膜蛋白质,在植物抵御非生物胁迫过程中具有非常重要的作用.为了研究砂藓水通道蛋白基因的生物学功能,利用干旱处理转录组测序获得的序列信息,克隆获得1个水通道蛋白家族中质膜内在蛋白基因序列,命名为RcPIP2.生物信息学结果显示,RcPIP2基因全长序列为1267 bp,包含807 bp的开放阅读框,编码含有268个氨基酸残基的蛋白质.该蛋白质分子质量预测为28.3 ku,理论等电点为6.64,为疏水性较强的稳定性蛋白;无信号肽,为非分泌型蛋白;含有6个跨膜结构域.保守结构域分析发现,RcPIP2具有膜内在蛋白(MIP)家族信号序列、高等植物高度保守序列HINPAVTFG和2个天门冬酰胺-脯氨酸-丙氨酸(NPA)基序.二级结构包括α螺旋(37.31％)、β折叠(20.9％)、无规则卷曲(38.43％).三级结构预测发现,RcPIP2蛋白质的立体结构为典型的四聚体形式,由4个圆筒状亚基和中间的孔道构成.系统进化树分析表明,RcPIP2与小立碗藓中的PIP2蛋白质亲缘关系较近,聚为一类.由此推测,RcPIP2基因为水通道蛋白家族成员.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张梅娟	齐齐哈尔大学生命科学与农林学院抗性基因工程与寒地生物多样性保护黑龙江省重点实验室	47	98	5.0	8.0
2	徐红红	齐齐哈尔大学生命科学与农林学院抗性基因工程与寒地生物多样性保护黑龙江省重点实验室	7	39	3.0	6.0
3	钱朋智	齐齐哈尔大学食品科学与工程学院	17	7	2.0	2.0
4	马天意	齐齐哈尔大学生命科学与农林学院抗性基因工程与寒地生物多样性保护黑龙江省重点实验室	8	3	1.0	1.0