串珠藻目植物psaA基因的适应性进化及共进化分析

• 作者: 冯佳 刘旭东 刘琪 南芳茹 吕俊平 巩超彦 谢树莲
• 来源期刊: 山西大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 串珠藻目 psaA基因 适应性进化 共进化
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 生命科学与环境科学
• 页码范围: 662-672
• 页数: 11页
• 分类号: Q941
• 字数: 4692字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13451/j.cnki.shanxi.univ(nat.sci.).2018.09.07.001

摘要

串珠藻目是淡水红藻中最重要的类群.psaA基因是植物叶绿体中进行光调节的重要基因,编码光系统Ⅰ反应中心跨膜复合物的中心蛋白A,又称P700脱辅基蛋白A,承担重要的生物学功能,构成植物光系统Ⅰ的中心架构.为了探究串珠藻目植物适应特殊生存环境的分子水平机制,选取串珠藻目及一些相近类群淡水红藻的psaA基因42条,并采用PAML4.8软件中的位点模型、分支模型和分支-位点模型,对选取类群的psaA基因进行了适应性进化分析.结果 表明:(1)所有内类群聚集为9个分支,其中,分支A为假枝藻属,分支B为Nocturama属,分支C为西斯藻属,分支D为连珠藻,分支E为胶串珠藻,分支F为熊野藻属,分支G为串珠藻属,分支H为暗紫红毛菜,分支Ⅰ为红索藻属;(2)没有在位点模型和分支-位点模型中检测到有统计学意义的正选择位点,提示该基因处于强烈的负选择作用之下并具有保守性;(3)基于详细的解析数据和氨基酸对的相关系数统计出共进化组(对)5组(20对),序列中所有共进化氨基酸对的平均距离27.808 6A,标准差12.325 2,基于氨基酸疏水相关性值统计出的共进化组(对)5组(12对),基于氨基酸分子量相关值统计出的共进化组(对)5组(15对),其中共有11对共进化氨基酸同疏水性、分子量都显著相关.本研究结果显示psaA基因在串珠藻目植物中是非常保守的,比较适用于属及以上分类单元群体的系统发育关系研究,同时,基于ω比值检验基因适应性进化具有准确性和有效性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢树莲	山西大学生命科学学院	183	1093	17.0	22.0
2	冯佳	山西大学生命科学学院	100	447	10.0	16.0
3	吕俊平	山西大学生命科学学院	29	70	5.0	6.0
4	刘琪	山西大学生命科学学院	28	68	5.0	6.0
5	刘旭东	山西大学生命科学学院	9	65	1.0	8.0
6	南芳茹	山西大学生命科学学院	16	23	3.0	4.0
7	巩超彦	山西大学生命科学学院	3	10	2.0	3.0