大豆PHD家族蛋白的全基因组鉴定及表达特征分析

• 作者: 孙明哲 孙晓丽 才晓溪 李建伟 杨珺凯 沈阳 贾博为 邬升杨
• 来源期刊: 作物杂志
• 关键词: 大豆 PHD转录因子 PHD家族分析 表达特征 逆境胁迫
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·种质资源·生物技术
• 页码范围: 55-65
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.16035/j.issn.1001-7283.2019.03.010

摘要

PHD(Plant Homeodomain Finger)基因家族编码一类锌指转录因子,广泛参与植物的生长发育和逆境应答过程.通过全基因组鉴定获得了95个大豆PHD家族蛋白.通过共线性分析、进化树构建、基因结构和功能结构域鉴定、GO注释分析、不同组织间和非生物胁迫下表达分析等,获得了大豆PHD家族基因复制、家族进化、保守结构域及基因表达等信息.结果 表明,大豆PHD基因在家族进化、基因结构和保守结构域上存在较大变异,可能参与Zn2+结合、DNA结合及表观遗传调控等分子过程,参与调控植物生长发育和逆境应答.这些结果为进一步研究大豆PHD家族在生长发育和逆境应答中的生物学功能提供重要线索.