北京婴幼儿腹泻中G1、G3型轮状病毒VP7基因分子进化动态分析

• 作者: 刘立颖 张又 德日 朱汝南 董慧瑾 贾立平 赵林清 钱渊
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 腹泻 轮状病毒(RV) G1 G3 VP7 分子进化动态
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 人类病毒研究论著
• 页码范围: 377-384
• 页数: 8页
• 分类号: R373.9|R511
• 语种: 中文
• DOI: 10.13242/j.cnki.bingduxuebao.003553

摘要

北京儿童腹泻中G1和G3型轮状病毒(Rotavirus,RV)的流行随时间动态变化.鉴于G1和G3型RV在疫苗研发设计中的重要地位,本研究依据前期对2007～ 2017北京腹泻就诊患儿中RV流行的监测结果,分别选取G1(15例)和G3(18例)型RV标本,应用DNAStar、MEGA 6.0和BEAST软件包及Datamonkey在线工具,分析和预测11年来其主要中和抗原VP7基因的分子进化动态.结果 显示G1和G3型RV同近年世界各地的各自主要流行株之间的进化距离近,相比同一进化树分支内参考株的VP7基因并没有表现出特有的氨基酸变异,提示并未有特别的基因变异直接改变北京G1和G3型RV的流行.本研究中北京G1和G3型RV最近共同祖先株形成时间分别约为2005年和1996年,其VP7基因平均进化速率分别为2.29×10-3和5.11×10-4氨基酸替换·位点-1·年-1.尽管G1型的变异速率大于G3型,但有意思的是它们均无正向选择变异位点.群体流行历史(Bayesian skyline plot,BSP)分析显示人群中G1和G3型RV的感染水平呈现缓慢下降,并均在2010年前后出现了跳跃式下降,随后有所上升并维持在较平稳的感染水平,基本符合北京腹泻儿童中RV流行趋势监测,据此推测群体免疫压力可能是影响G1和G3型RV的流行分布随时间动态变化的原因.分子分析结果还显示本研究中G1和G3型RV和相应型别疫苗株之间的进化距离远,且均在主要抗原区存在变异,这些是否对疫苗应用效果产生影响仍需要对RV的流行进行持续监测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱汝南		49	694	14.0	25.0
2	赵林清		37	362	10.0	18.0
3	钱渊		93	1074	15.0	29.0
4	刘立颖		10	63	6.0	7.0
5	董慧瑾		8	59	6.0	7.0
6	张又		15	238	8.0	15.0
7	贾立平		9	48	5.0	6.0
8	德日		1	0	0.0	0.0