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印度谷螟PintGOBP2基因的全长序列克隆及其生物信息学分析
印度谷螟PintGOBP2基因的全长序列克隆及其生物信息学分析
作者:
李慧
王殿轩
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
印度谷螟
普通气味结合蛋白
基因克隆
生物信息学分析
摘要:
印度谷螟Plodia interpunctella(Hübner),是一种危害性较严重的仓储害虫,在我国广泛分布.在其感染寄主的过程中,气味结合蛋白(OBPs)对印度谷螟的行为反应有重要作用.通过转录组数据筛选、鉴定获得印度谷螟OBP基因序列,并命名为PintGOBP2,用DNAMAN对其进行序列分析,BLAST进行同源性比较,并使用MEGA6.0构建系统发育进化树.结果表明:印度谷螟普通气味结合蛋白PintGOBP2的编码基因开放阅读框全长426 bp,编码141个氨基酸,预测分子量为15.48 kDa,等电点为4.39;N末端具有16个氨基酸残基组成的信号肽序列,并含有由6个半胱氨酸组成的保守片段,属于Classical OBPs亚家族基因.同源比对结果表明,PintGOBP2基因编码蛋白与其他鳞翅目昆虫GOBP蛋白具有较高的同源性.进化树分析结果表明,PintGOBP2基因与翅目昆虫GOBP超家族内相关基因的同源很高.研究结果为进一步分析印度谷螟PintGOBP2蛋白在其嗅觉信号传导过程中的生理功能提供了基础材料.
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文献信息
篇名
印度谷螟PintGOBP2基因的全长序列克隆及其生物信息学分析
来源期刊
粮油食品科技
学科
生物学
关键词
印度谷螟
普通气味结合蛋白
基因克隆
生物信息学分析
年,卷(期)
2019,(5)
所属期刊栏目
生物工程
研究方向
页码范围
75-82
页数
8页
分类号
Q966
字数
4400字
语种
中文
DOI
10.16210/j.cnki.1007-7561.2019.05.015
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
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王殿轩
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主办单位:
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出版周期:
双月刊
ISSN:
1007-7561
CN:
11-3863/TS
开本:
大16开
出版地:
北京市西城区百万庄大街11号
邮发代号:
82-790
创刊时间:
1991
语种:
chi
出版文献量(篇)
3581
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20026
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