基于SLAF-seq技术的甘薯种质资源群体遗传进化分析

• 作者: 吴翠荣 李彦青 李慧峰 滑金锋 范继征 陈天渊 黄咏梅
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘薯 种质资源 SLAF-seq 遗传进化分析
• 年，卷（期）: 2019,（12）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 2390-2396
• 页数: 7页
• 分类号: S531
• 字数: 3697字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2019.12.011

摘要

基于简化基因组测序技术对122份甘薯种质资源进行分析,开发SNP位点并将其应用于种质资源群体结构和遗传进化分析.结果表明,从122份甘薯种质资源中共获得563.18 Mb读长,不同材料的读长数量在1419809～8392785范围之间.测序质量值Q30在90.61％～96.82％之间,平均Q30为92.78％.测序获得的GC含量在36.46％～40.33％之间,平均GC含量为38.17％,对照GC含量为40.72％.根据测序结果共开发出高质量的SLAF标签2388759个,平均测序深度为17.45×.其中,多态性的SLAF标签77761个,占SLAF标签总数的3.26％.根据所获得多态性SLAF标签统计SNP位点信息,共计获得129063个群体SNP位点.遗传进化分析表明122份种质资源可以分为3个大类,分类结果与它们的地理来源无直接关系,聚类结果可为甘薯育种亲本组配和杂种优势利用提供科学依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李彦青	广西农业科学院玉米研究所	18	110	7.0	10.0
2	黄咏梅	广西农业科学院玉米研究所	18	110	7.0	10.0
3	范继征	广西农业科学院玉米研究所	21	123	7.0	10.0
4	吴翠荣	广西农业科学院玉米研究所	16	82	6.0	8.0
5	李慧峰	广西农业科学院玉米研究所	14	68	6.0	7.0
6	陈天渊	广西农业科学院玉米研究所	15	86	6.0	9.0
7	滑金锋	广西农业科学院玉米研究所	7	19	2.0	4.0