牙鲆cbx2基因的分子特征与组织表达

• 作者: 张俊玲 施志仪 王新艳
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 牙鲆 cbx2 性腺 生物信息学分析 RT-PCR
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 69-75
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2018-0995

摘要

为鉴定牙鲆(Paralichthys olivaceus)色素框同源蛋白(Chromobox homolog,CBX)基因cbx2及探讨其在牙鲆性腺中的表达,通过PCR克隆和测序获得了cbx2 cDNA序列;利用多种生物信息学方法在线分析了牙鲆CBX2蛋白质的理化性质与空间结构,并比较了脊椎动物中cbx2的基因结构、氨基酸同源性、系统进化;运用RT-PCR技术分析了cbx2基因在牙鲆成体不同组织的表达情况.结果 表明获得的牙鲆cbx2 cDNA序列包含1 584 bp的开放阅读框,编码527个氨基酸,其蛋白质分子量和等电点分别为56 578.98和10.03,是一种偏碱性的亲水性蛋白,该蛋白无信号肽,无跨膜区域,且编码该蛋白的氨基酸中以丝氨酸(Sr)的含量为最高;空间结构分析发现,牙鲆CBX2蛋白以α螺旋和无规则卷曲为主,其二级结构中含有1个染色质结构域和4个低复杂结构域,该染色质结构域常结合甲基化氨基酸残基.基因结构、氨基酸同源性和系统进化分析表明cbx2基因在脊椎动物进化中较为保守,牙鲆cbx2与尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)、青鳉(Oryzias latipes)的基因结构更为相似,其氨基酸同源性与杜氏()(Seriola dumerili)最高,为89％.RT-PCR结果显示牙鲆cbx2基因在精巢的表达量最高,卵巢次之,而在其他组织中仅有较低的表达.这些结果提示了cbx2基因在牙鲆的性腺发育中可能具有重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	施志仪	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	48	217	9.0	11.0
10	张俊玲	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	19	79	5.0	8.0
19	王新艳	上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室	1	0	0.0	0.0