健康人群不同年龄组肠道菌群特征预测模型的研究

• 作者: 吴竞 孙刚 李丛勇 石金龙 薛万国 赵义名 赵敏
• 来源期刊: 解放军医学院学报
• 学科: 医学
• 关键词: 肠道菌群 随机森林算法 健康人群
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 专题:医学大数据研究
• 页码范围: 734-739
• 页数: 6页
• 分类号: R574
• 字数: 3224字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-5227.2019.08.007

摘要

目的 利用16S测序数据建立健康人年龄段预测模型,探索不同年龄组肠道菌群特征.方法 基于SRA数据库中2016年923例16S测序数据筛选特征操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs),应用随机森林算法建立幼儿园学生、小学生、中学生、青年人、中年人、老年人和长寿老人7个年龄段预测模型,分析组间菌群差异特征及功能,计算特征OTUs与组间差异通路的相关性.结果 基于278个与年龄变化相关的OTUs建立随机森林年龄段预测模型,准确率达到72.9％;不同年龄组之间存在249个显著差异通路,主要是异生素生物降解和代谢、脂质代谢和氨基酸代谢通路;在菌群组成和功能层面聚类分析,学生组和中年人组聚为一类,青年人组、老年人组和长寿老人组聚为一类.结论 预测模型以及组间聚类结果均说明学生组和中年人组肠道菌群相似,老年人、长寿老人与青年人之间的菌群特征更相近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	薛万国	解放军总医院医疗大数据中心	69	873	15.0	27.0
2	孙刚	解放军总医院第一医学中心消化内科	90	552	13.0	18.0
3	赵敏	解放军总医院医疗大数据中心	20	76	6.0	6.0
4	石金龙	解放军总医院医疗大数据中心	3	1	1.0	1.0
5	李丛勇	解放军总医院第一医学中心消化内科	2	4	1.0	2.0
6	吴竞	解放军总医院医疗大数据中心	1	0	0.0	0.0
7	赵义名	解放军总医院第一医学中心消化内科	1	0	0.0	0.0