转录组分析氧化胁迫对毛白杨悬浮细胞生长发育的影响

• 作者: 尹玢 陆海
• 来源期刊: 北京林业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 毛白杨 活性氧 悬浮细胞 生长发育 转录组测序
• 年，卷（期）: 2019,（9）
• 所属期刊栏目: 林学
• 页码范围: 90-98
• 页数: 9页
• 分类号: S718.43|S792.117|Q943.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.13332/j.1000-1522.20190157

摘要

[目的]毛白杨是多年生木本植物,由于其固着的生长模式,毛白杨存在长期承受胁迫的可能性.氧化胁迫是常见的非生物胁迫方式,在多个物种中均有不同程度的研究,然而以毛白杨为材料在转录水平的研究目前鲜有报道.通过转录组数据探明活性氧平衡的打破对毛白杨悬浮细胞生长发育的影响.[方法]本研究对毛白杨悬浮细胞系进行H2O2胁迫处理,通过激光共聚焦显微镜和转录组测序技术(RNA-Seq),观察、分析了线粒体的形态学和基因表达量的差异.[结果]通过对转录组数据的分析得到了806个显著差异基因(P<0.001且|log2ratio|>1),其中449个差异基因下调,357个差异基因上调.这些差异基因涉及细胞分裂、细胞分裂素的激活、赤霉素调控以及磷酸化途径.通过线粒体特异性染料并使用激光共聚焦显微镜观察氧化胁迫条件下毛白杨线粒体的形态学,结果表明氧化胁迫下线粒体以蠕虫状为主.[结论]通过分析氧化胁迫条件下细胞转录组数据,在RNA水平揭示了氧化胁迫对植物细胞生长发育的影响,为植物的应激反应和生长发育研究提供了理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陆海	北京林业大学生物科学与技术学院	69	729	14.0	24.0
2	尹玢	北京林业大学生物科学与技术学院	4	6	1.0	2.0