龙眼HD-Zip基因家族生物信息及表达分析

• 作者: 张春渝 徐小萍 林玉玲 申序 赖钟雄 陈晓慧
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 龙眼 HD-Zip基因 体胚 表达模式
• 年，卷（期）: 2019,（10）
• 所属期刊栏目: 热带植物基因组学与基因编辑专题
• 页码范围: 1914-1923
• 页数: 10页
• 分类号: S667.2
• 字数: 7963字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2019.10.004

摘要

为了解龙眼HD-Zip基因家族的功能,本研究基于龙眼基因组与转录组数据库,对提取的19个龙眼HD-Zip家族成员的启动子、可变剪接以及受到调控的miRNA种类进行分析;并采用实时荧光定量PCR技术,分析了在ABA处理下龙眼胚性愈伤组织(embryonic callus,EC)中HD-Zip部分成员的表达模式,以及HD-Zip部分成员在不同体胚阶段的表达模式.结果表明:龙眼HD-Zip家族除含有TATA-box和CAAT-box以外还含有大量的光响应元件、激素响应元件以及胁迫响应元件,暗示龙眼HD-Zip家族成员可能参与光反应、激素响应以及非生物胁迫的过程;龙眼HD-Zip在不同组织部位与不同体胚阶段的可变剪接方式主要以内含子保留为主;龙眼HD-Zip基因家族成员主要受到miRNA166a的调控;在外源激素ABA处理下龙眼EC中HD-Zip家族部分成员的表达模式以及部分成员在不同体胚阶段的表达模式都呈现多样化,推测龙眼HD-Zip参与龙眼不同体胚发育的调控,并且可能通过调节内源ABA的浓度进而影响胚性愈伤组织的生长发育以及形态的建成.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖钟雄	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	473	4127	31.0	41.0
2	林玉玲	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	148	560	10.0	16.0
3	徐小萍	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	25	20	3.0	3.0
4	陈晓慧	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	20	13	3.0	3.0
5	张春渝	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	3	0	0.0	0.0
6	申序	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	4	0	0.0	0.0