一株血液分离的维氏气单胞菌的鉴定及系统发育分析

• 作者: 张衎 李先平 李芮冰 王敏 田菁菁
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 关键词: 维氏气单胞菌 鉴定 16SrRNA 系统发育树
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 细菌学
• 页码范围: 370-377
• 页数: 8页
• 字数: 6700字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2019.05.008

摘要

目的 对一株血液分离的未知致病菌株X1进行鉴定,并对维氏气单胞菌维氏亚种、温和亚种和嗜水气单胞菌进行系统发育分析,了解维氏气单胞菌的遗传进化情况.方法 未知致病菌X是2016年初从中南大学湘雅二医院的一位住院患者血液中分离所得,通过形态学、生理生化特性观察及聚合酶链反应技术(polymerase chain reaction,PCR)检测并测序其16S rRNA的方法对X1进行最终鉴定;应用DNASP5.1对其与GenBank中相近种属进行种群间比对,并基于遗传距离构建系统发育树分析其遗传学进化情况.结果 此未知菌株X1为革兰阴性杆菌,生化反应:氧化酶(+),葡萄糖(+),VP(+),枸橼酸盐(-);经16S rRNA基因序列分析,同源性分析表明致病株X1与气单胞菌属自然类聚(相似度97％ ～99％,Score:2170～2149 bits),通过MEGA5.0计算发现X1与维氏气单胞菌X71120.1的遗传距离最小(0.014),但尚不能鉴定到亚种.根据该X1菌株和GenBank上已发表的气单胞菌株的16S rRNA序列进行系统发育分析,可见维氏亚种和温和亚种核苷酸歧异度和净遗传距离最小;但系统发育树却见维氏亚种单独聚为一大类,温和亚种和嗜水气单胞菌聚为另一大类.结论 致病株X1通过形态学观察、生理生化测定、16S rRNA的同源性分析和系统发育分析鉴定为维氏气单胞菌,并丰富该菌的系统发育等方面的相关信息,了解维氏气单胞菌的进化状况.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王敏	中南大学湘雅二医院检验科	175	1039	16.0	24.0
2	李先平	中南大学湘雅二医院检验科	50	198	8.0	10.0
3	张衎	中南大学湘雅二医院检验科	1	0	0.0	0.0
4	田菁菁	中南大学湘雅二医院检验科	2	1	1.0	1.0
5	李芮冰	中南大学湘雅医学院医学检验系	1	0	0.0	0.0