基于线粒体DNA细胞色素b基因和控制区序列分析西藏雅鲁藏布江黄斑褶种群遗传多样性

• 作者: 李雷 林小婉 金星 金洪宇 马波 马清芝
• 来源期刊: 动物学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 黄斑褶 线粒体DNA 细胞色素b基因 D-loop控制区 遗传多样性 雅鲁藏布江
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 701-710
• 页数: 10页
• 分类号: Q953
• 语种: 中文
• DOI: 10.13859/j.cjz.201905011

摘要

采用线粒体DNA (mtDNA) Cyt b基因和D-loop控制区为分子标记,对分布于西藏雅鲁藏布江大峡谷以上里龙段和以下墨脱段2个群体的黄斑褶(Pseudecheneis sulcata)共60个样本进行遗传多样性研究.获得联合基因有效序列长度为1 893 bp,包括Cyt b基因1 060 bp和D-loop控制区833 bp.结果 显示,里龙和墨脱2个群体的单倍型多样性值(Hd)均较高(0.701和0.761),核苷酸多样性值(π)均较低(0.001 00和0.001 09);高频率的单倍型Hap1和Hap2为2个群体所共享,推测为祖先单倍型;同时,里龙和墨脱群体分别存在5个和6个特有单倍型,且在2个群体中不共享;分子方差分析(AMOVA)显示遗传变异主要来源于种群内部,群体间呈中度遗传分化水平(Fst=0.090 44,P＜0.05);中性检验(Tajima'sD、Fu's Fs)和核苷酸不配对(SSD、Hir)分析结果揭示,黄斑褶种群曾经历过种群扩张现象.本研究推测,黄斑褶2个群体间的基因流动存在障碍,雅鲁藏布大峡谷的海拔落差及水文情势等生态屏障可能是阻碍黄斑褶迁徙和交流的主要原因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马波	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	44	424	12.0	18.0
2	金星	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	8	31	3.0	5.0
3	李雷	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	13	19	4.0	4.0
4	马清芝		2	0	0.0	0.0
8	林小婉		1	0	0.0	0.0