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肺腺癌预后甲基化基因生物标志物鉴定
肺腺癌预后甲基化基因生物标志物鉴定
作者:
李青
王莉
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
肺腺癌
预后
甲基化
生物标志物
摘要:
目的 寻找一种有效的甲基化基因生物标志物,用于肺腺癌的预后预测.方法 从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载219例肺腺癌和29例正常肺组织样本DNA甲基化数据及临床信息,采用Cox比例风险回归模型进行DNA甲基化生物标志物的鉴定,使用时间依赖性受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评估该模型的性能,通过基因本体论(Gene Ontology,GO)进行功能注释,探讨DNA甲基化标志物的生物学功能.结果 基因差异甲基化分析,鉴定了160个差异甲基化基因.通过Cox回归分析,筛选出生存相关的4个DNA甲基化基因(AF131215.8、AL021918.1、RP11.386G11.3和ZNF382)作为肺腺癌预后生物标志物.Kaplan-Meier和ROC分析显示,患者总生存期比较低风险组(1.97年)明显高于高风险组(0.54年),差异比较具有统计学意义(P<0.001),并且具有很好的预测能力(AUCSignature=0.793).多因素Cox回归分析结果表明筛选出生存相关的生物标志物是独立预后因子.GO功能注释显示,这些基因主要参与转录激活活性、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录、蛋白质异源二聚体活性和RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控等.结论 鉴定出4个DNA甲基化基因作为预测肺腺癌预后的生物标志物并且是独立预后因子.
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文献信息
篇名
肺腺癌预后甲基化基因生物标志物鉴定
来源期刊
转化医学杂志
学科
医学
关键词
肺腺癌
预后
甲基化
生物标志物
年,卷(期)
2019,(6)
所属期刊栏目
肿瘤与转化
研究方向
页码范围
333-338
页数
6页
分类号
R734.2
字数
4342字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.2095-3097.2019.06.004
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王莉
重庆医科大学附属第三医院呼吸疾病中心
52
289
11.0
14.0
2
李青
陆军军医大学新桥医院肿瘤科
2
0
0.0
0.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
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共引文献
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参考文献
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二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
肺腺癌
预后
甲基化
生物标志物
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
转化医学杂志
主办单位:
海军总医院
出版周期:
双月刊
ISSN:
2095-3097
CN:
10-1042/R
开本:
大16开
出版地:
北京市海淀区阜成路6号
邮发代号:
创刊时间:
1988
语种:
chi
出版文献量(篇)
938
总下载数(次)
2
总被引数(次)
2219
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