Mn2+对偏肿革裥菌3个锰过氧化物酶基因在转录水平上的调控

• 作者: 于存 吴书景 池玉杰
• 来源期刊: 吉林农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 锰过氧化物酶基因 生物信息学比对 锰离子 转录调控 荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 页码范围: 540-552
• 页数: 13页
• 分类号: Q949.32|S567.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.13327/j.jjlau.2019.4508

摘要

检测了不同浓度的Mn2+对偏肿革裥菌3个锰过氧化物酶(MnPs)基因Lg-mnp1、2、3在转录水平上的调控作用,为研究MnPs基因的表达调控机制奠定基础.用相关生物信息学方法对基因和蛋白序列进行比对与分析,用qPCR检测了在LNAS培养基内Mn2+4种不同浓度下(0,40,200,400μmol/L)3个基因在转录水平上的相对表达量.结果表明:3个Lg-mnps在基因结构上不尽相同,既有较多的相似之处,也存在着差异.在外显子的长度和序列组成、内含子的位置上,Lg-mnp1与Lg-mnp2更一致,而Lg-mnp3与二者一些特征相似、一些不尽相同.系统发育分析表明,Lg-mnp1和Lg-mnp2比Lg-mnp3更接近.3个Lg-mnps基因在转录水平上都受不同浓度的Mn2+差异调控,在不同浓度的Mn2+和不同时间条件下的转录水平各不相同,Lg-mnp1的最高转录量是在11 d时200μmol/L Mn2+下,为0.043;Lg-mnp2的转录变化曲线与Lg-mnp1相似,但最高转录量是在9 d时200μmol/L Mn2+下,为0.929;Lg-mnp3与Lg-mnp1、2不尽相似,最高转录量是在11 d时40μmol/L Mn2+下,为0.106.Lg-mnp2的转录水平5 d后几乎在所有浓度Mn2+条件下都远远高于Lg-mnp1和Lg-mnp3的转录水平.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	池玉杰	东北林业大学林学院	75	791	12.0	25.0
2	于存	贵州大学林学院	18	13	2.0	3.0
3	吴书景		2	0	0.0	0.0