象甲科线粒体基因组特征及系统发育分析

• 作者: 李沅秋 杨瑶君 罗朝兵 陈英
• 来源期刊: 环境昆虫学报
• 学科: 农学
• 关键词: 象甲科 线粒体基因组 基因重排 进化 系统发育
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 生理与生化
• 页码范围: 1297-1310
• 页数: 14页
• 分类号: Q963|S433.5
• 字数: 7967字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-0858.2019.06.19

摘要

昆虫线粒体基因组广泛应用于系统发育关系的重新建立、 分子进化、 谱系地理学及物种诊断等领域.为揭示象甲科昆虫线粒体全基因组序列的主要结构特征,探究其系统发育相关信息,为进化遗传学研究和分子标记选取等提供参考依据,本研究利用比较基因组学和生物信息学方法,对NCBI上已公布的35种象甲科物种线粒体全基因组序列进行了分析.结果显示:(1)象甲科tRNA基因存在排序及数目异常情况,不同物种中蛋白质编码基因和2种rRNAs排列相同,线粒体全基因组具有明显AT偏向;(2)COX1、ATP6、ND5、ND4、ND4L和ND1基因除标准三联密码子外,还存在特殊的起始密码子AAT、TTG和GTG;(3)13种蛋白质编码基因的进化速率顺序为COX3>ATP8>ND2>ND5>ND1>ND4>ND6>ND4L>ND3>ATP6>Cytb>COX1>COX2;(4)13个蛋白编码基因和rRNAs基因中,ND5、rrnL、ND4和ND2基因变异位点数较高,可作为备选的分子标记;(5)各亚科的系统发育关系可能为(((小蠹亚科Scolytinae+长小蠹亚科Platypodinae)+(隐喙象亚科Cryptorhynchinae+魔喙象亚科Molytinae+象虫亚科Curculioninae)+((孢喙象亚科Cyclominae+粗喙象亚科Entiminae)+(隐颏象亚科Dryophthorinae+长小蠹亚科))),为象甲科的系统发育分析有提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨瑶君	乐山师范学院竹类病虫防控与资源开发四川省重点实验室	37	132	7.0	10.0
2	李沅秋	西华大学食品与生物工程学院	3	0	0.0	0.0
4	罗朝兵	乐山师范学院竹类病虫防控与资源开发四川省重点实验室	4	0	0.0	0.0
7	陈英	西华大学食品与生物工程学院	3	0	0.0	0.0