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摘要:
目的 了解广东地区少数民族献血者的丙型肝炎病毒(HCV)基因型分布以及不同基因型之间的进化距离.方法 本研究收集2009-2015年广东地区少数民族献血者的HCV RNA阳性标本共44份,对其进行HCV E1基因的巢式PCR扩增并测序获得序列.通过MEGA 7.0对上述标本进行基因分型,采用p-distance对广东地区汉族和少数民族感染的HCV的进化距离进行计算,并分析广东地区少数民族和汉族的基因分布差异.结果 共获得少数民族献血者40条HCV E1基因序列,经分析其基因型主要为1b (13个)和6a(12个),其他依次为3a(5个)、3b(4个)、1a(3个)、2a(2个)和4a(1个).相对于1b(x2=13.2,P<0.01)、3b (x2=4.37,P<0.05)、3a(x2=6.0,P<0.05)、2a (x2=10.98,P<0.01)和6a (x2=11.15,P<0.01),亚型4a在少数民族中的分布远远高于其在汉族中的分布.相对于1b(x2 =19.07,P<0.01)、3b (x2=4.51,P<0.05)、3a (x2=6.86,P<0.01)、2a (x2=11.42,P<0.01)和6a (x2=15.69,P<0.01),亚型1a在少数民族中的分布远远高于其在汉族人群中的分布.少数民族感染的HCV进化距离远远大于汉族感染的HCV进化距离(t=-10.01,P<0.01).结论 广东地区少数民族感染的HCV基因型分布和汉族的基因型分布不同,并且,少数民族感染的HCV之间的进化距离大于汉族感染的HCV进化距离.
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文献信息
篇名 2009-2015年广东地区少数民族献血者丙型肝炎病毒基因型分布的研究
来源期刊 中国病毒病杂志 学科 医学
关键词 丙型肝炎病毒 进化树 基因型 进化距离 少数民族
年,卷(期) 2019,(5) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 351-356
页数 6页 分类号 R512.6+3
字数 语种 中文
DOI 10.16505/j.2095-0136.2019.0062
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