牦牛死亡结构域蛋白(FADD)基因克隆与生物信息学分析

• 作者: 何向东 夏忆 字向东 陈莹 马瑶
• 来源期刊: 中国草食动物科学
• 学科: 农学
• 关键词: 牦牛 FADD基因 生物信息学分析 基因克隆
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 遗传育种与繁殖
• 页码范围: 7-11
• 页数: 5页
• 分类号: S823.2
• 字数: 4153字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-3887.2019.06.002

摘要

死亡结构域蛋白(FADD)是在生物细胞里起到信号转导作用的一种蛋白,在胚胎发育、细胞凋亡过程中发挥重要的生物学活性.实验以成年母牦牛的卵巢RNA为模板,利用RT-PCR技术克隆牦牛FADD基因,并进行了生物信息学分析.结果表明:牦牛FADD基因CDS区长度630 bp,编码209个氨基酸,蛋白分子式C996H1632N300O307S7,整个蛋白质带负电荷,总共原子数量3242;分子质量23.0 ku,半衰期30 h;理论等电点6.11;消光系数18240;不稳定指数49.08,属于不稳定蛋白;脂肪系数104.64,平均亲水系数-0.168,预测FADD蛋白为亲水蛋白.系统进化树表明,牦牛与哺乳动物亲缘关系近,与鱼亲缘关系最远,符合物种进化规律.FADD蛋白质的二级结构α螺旋、自由卷曲、β-转角和延伸链,占靶蛋白的比例分别为71.29％、22.97％、3.83％和1.91％,与三级结构相符.牦牛FADD蛋白有13.0％位于细胞核、52.2％位于细胞质、8.7％位于细胞外、13.0％位于线粒体、4.3％位于高尔基体和8.7％位于细胞骨架.该研究成功克隆出牦牛FADD基因CDS区,为进一步研究其功能提供了一定理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	字向东	西南民族大学动物科学国家民委重点实验室	81	350	9.0	15.0
2	陈莹	西南民族大学动物科学国家民委重点实验室	13	38	3.0	6.0
3	何向东	西南民族大学动物科学国家民委重点实验室	10	3	1.0	1.0
4	夏忆	西南民族大学动物科学国家民委重点实验室	8	3	1.0	1.0
5	马瑶	西南民族大学动物科学国家民委重点实验室	2	1	1.0	1.0