头颈鳞状细胞癌相关致病基因的筛选和临床分析

• 作者: 尹时华 廖行伟 翟思佳 黄巧
• 来源期刊: 中国耳鼻咽喉颅底外科杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 头颈鳞状细胞癌 差异表达基因 生物信息学 生存分析
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 385-392
• 页数: 8页
• 分类号: R739.91
• 字数: 4579字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11798/j.issn.1007-1520.201904011

摘要

目的 筛选头颈鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),进一步探究其潜在分子机制.方法 从Gene Expression Omnibus (GEO)数据库下载HNSCC基因芯片数据集,通过GE02R鉴定HNSCC与正常样本间的DEGs,并对DEGs进行基因本体(gene ontology,GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析,应用Cytoscape进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络构建,最后通过UALCAN数据库进行生存分析.结果 筛选出143个DEGs,其中上调基因50个,下调基因93个.GO分析显著富集在胶原分解代谢过程、细胞粘附及蛋白水解等生物过程,KEGG通路分析显著富集在药物代谢、核因子-κB(muclear factor-κB,NF-κB)信号通路、ECM-受体相互作用、补体和凝血级联等通路.PPI网络构建筛选出15个HNSCC相关核心基因,其中PLAU、SPP1、TIMP1被鉴定为临床相关基因.结论 SPP1是抗癌治疗的良好靶标,也是指导放射治疗的标志物.PLAU和TIMP1可能是HNSCC的关键基因,有望成为分子靶向治疗的新靶点,PLAU和SPP1可能通过NF-κB信号通路调节HNSCC发展.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	尹时华	广西医科大学第二附属医院耳鼻咽喉头颈外科	60	168	7.0	10.0
2	廖行伟	广西医科大学第二附属医院耳鼻咽喉头颈外科	7	0	0.0	0.0
3	黄巧	广西医科大学第二附属医院耳鼻咽喉头颈外科	7	1	1.0	1.0
4	翟思佳	广西医科大学第二附属医院耳鼻咽喉头颈外科	7	3	1.0	1.0