大豆Whirly基因家族的鉴定和表达分析

• 作者: 李清 王洪 罗秋兰 郭禄芹
• 来源期刊: 大豆科学
• 关键词: 大豆 Whirly基因家族 基因表达 干旱 盐害
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 204-211
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2019.02.0204

摘要

Whirly家族是一类植物特异的转录因子,它们能与单链DNA分子结合,无论在细胞核还是在细胞器内都有着广泛而复杂的生物学功能.然而,目前还没有关于大豆Whirly基因的研究报道.本研究首次在全基因组水平鉴定和综合描述大豆Whirly基因家族成员,以期为它们的后续功能研究提供理论基础.该研究在大豆基因组中鉴定到了7个Whirly基因,并对其理化性质、亚细胞定位、进化关系、基因结构、蛋白基序组成、三维结构和基因表达模式等进行综合分析.根据它们的进化关系、基因结构和蛋白基序组成,将其分为两大类.蛋白三维结构分析结果表明,GmWHY5蛋白由于N端的缺失,缺少了β1-4和α1,与其它大豆Whirly蛋白结构差异很大.利用已公布的转录组数据进一步研究了大豆Whirly基因的表达谱,结果显示其组织和胁迫表达模式差异很大.例如GmWHY1、Gn WHY2、GmWHY6和GmWHY7的表达水平明显高于Gm WHY3、GmWHY4和GmWHY5.总之,这些发现将为大豆Whirly基因家族的研究提供重要的资源,并为进一步阐明其分子机制奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王洪	深圳大学生命与海洋科学学院	1	1	1.0	1.0
2	郭禄芹	深圳大学生命与海洋科学学院	1	1	1.0	1.0
6	罗秋兰	深圳大学生命与海洋科学学院	1	1	1.0	1.0