簸箕柳AP2/ERF家族基因的全基因组分析

• 作者: 李校 沈方圆 王皆恒 田应明
• 来源期刊: 四川大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 簸箕柳 AP2/ERF转录因子 生物信息学 表达模式
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 生物学
• 页码范围: 983-988
• 页数: 6页
• 分类号: Q943.2
• 字数: 4890字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0490-6756.2019.05.030

摘要

为了研究簸箕柳AP2/ERF转录因子家族的成员和分类,及后续深入探究其在簸箕柳生长发育过程中的功能,本文基于簸箕柳基因组数据,利用生物信息学技术和方法,对簸箕柳的AP2/ERF家族基因进行鉴定、分类及染色体定位,并对其理化性质、基因结构、保守结构域、表达模式等进行分析.结果表明,簸箕柳含有178个AP2/ERF家族基因,并根据AP2/ERF保守域的数量与拟南芥AP2/ERF家族基因的进化关系将其划分成AP2、ERF、RAV和Soloist亚家族4类.此外组织表达模式分析结果显示,簸箕柳AP2/ERF家族基因的表达具有明显的组织特异性,且在leaf、root、shoot、flower中表达较强,在其他组织中表达较弱.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李校	四川大学生命科学学院四川省分子生物与生物技术重点实验室	10	16	2.0	3.0
2	田应明	四川大学生命科学学院四川省分子生物与生物技术重点实验室	2	1	1.0	1.0
3	王皆恒	四川大学生命科学学院四川省分子生物与生物技术重点实验室	1	0	0.0	0.0
4	沈方圆	四川大学生命科学学院四川省分子生物与生物技术重点实验室	1	0	0.0	0.0