医疗废物堆置场地土壤抗生素抗性基因组成特征——以华东丘陵地区某医废堆场为例

• 作者: 孔德洋 张后虎 池婷 赵震乾
• 来源期刊: 应用与环境生物学报
• 学科: 地球科学
• 关键词: 抗生素抗性基因 土壤 医疗废物 高通量测序 环境污染
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 561-569
• 页数: 9页
• 分类号: X53
• 语种: 中文
• DOI: 10.19675/j.cnki.1006-687x.2018.08030

摘要

抗生素抗性基因(Antibiotic resistance genes,ARGs)目前已经被认为是一种重要的环境污染物;土壤中存在的微生物代表了ARGs的古老进化起源之一,并且已被认为是临床病原体获得ARGs的重要交换介质.为测试医疗废物堆置区域的ARGs丰度,在医废堆置区内外采集了共28个土壤样品.在提取样品中的微生物宏基因组之后,对所提取的DNA进行高通量测序.将所得序列与抗生素抗性基因数据库进行比对,并通过计算不同类型以及不同亚型的ARGs拷贝数/16S rRNA基因拷贝数评估ARGs的组成.结果显示,医废堆置区内样本所含的氨基糖苷类、氯霉素类、磺胺类、四环素类ARGs丰度显著高于堆置区外样本(分别达到了0.0134±0.0138、0.00615±0.00747、0.0188±0.0254以及0.00504±0.00292 ARGs拷贝数/16S rRNA基因拷贝数),特别是sul1(磺胺类)、floR(氯霉素类)、catB(氯霉素类)、aph(3”)-I(氨基糖苷类)和tetG(四环素类)这5类ARGs亚型;同时,医废堆置区内样本有着更高的ARGs多样性(t-test,P＜0.05).本研究表明医疗废物堆置会显著提高区域内土壤中ARGs的丰度以及多样性,从而增加潜在环境风险.