一株2013年云南省Ⅲ型疫苗相关脊髓灰质炎病毒全基因组分析

• 作者: 刘红波 孙浩 张名 张捷 张海浩 杨昭庆 赵义林 马绍辉 黄小琴
• 来源期刊: 中国病毒病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 疫苗相关脊髓灰质炎病毒 进化分析 遗传特性
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 195-201
• 页数: 7页
• 分类号: R373.22
• 语种: 中文
• DOI: 10.16505/j.2095-0136.2019.0024

摘要

目的 分析一株疫苗相关脊髓灰质炎病毒(vaccine-related poliovirus,VRPV)云南分离株R1351/YN/CHN/2013的全基因组序列和遗传特性.方法 采用RD细胞分离获得病毒,提取病毒RNA,通过RT-PCR扩增全基因组序列并测序.利用BioEdit 7.09、MEGA7.0、SimPlot3.5.1等软件对全基因序列进行分析.结果 R1351/YN/CHN/2013全基因序列由7 430个核苷酸构成,编码含2 206个氨基酸残基的多聚蛋白,5'UTR和3'UTR核苷酸长分别为742 nt和70 nt;与Sabin3疫苗株全基因核苷酸和氨基酸序列的同源性分别为99.7％和99.6％;在5'UTR的减毒位点(nt472)发生回复突变,在VP3减毒位点(nt2034)未发生改变;与Sabin3疫苗株的VP1序列比对,共发生3个碱基突变,变异率为0.33％.进化分析显示73株Ⅲ型脊髓灰质炎病毒株分为A、B和C三个分支,R1351/YN/CHN/2013属于C分支,Sabin1/2疫苗株独立形成两个分支.重组分析表明R1351/YN/CHN/2013基因组各区域并未与Sabin1/2疫苗株及其他肠道病毒发生重组.结论 R1351/YN/CHN/2013为Ⅲ型VRPV,并且在减毒位点nt472处发生了回复突变.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马绍辉	中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室	15	14	2.0	3.0
2	杨昭庆	中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室	26	403	5.0	20.0
3	黄小琴	中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室	22	63	4.0	7.0
4	张捷	中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室	10	13	2.0	3.0
5	张名	中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室	3	3	1.0	1.0
6	孙浩	中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室	11	20	2.0	4.0
7	张海浩	中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室	3	0	0.0	0.0
8	赵义林	中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室	2	0	0.0	0.0
9	刘红波	中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室	3	0	0.0	0.0