葡萄EST-SSR标记的开发及其在遗传多样性分析中的应用

• 作者: 卢世雄 梁国平 毛娟 王萍 陈佰鸿 马宗桓
• 来源期刊: 中外葡萄与葡萄酒
• 学科: 农学
• 关键词: 葡萄 EST-SSR 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 12-19
• 页数: 8页
• 分类号: S663.1
• 字数: 4567字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13414/j.cnki.zwpp.2019.06.002

摘要

为开发高效实用的EST-SSR基因标记,从220547条葡萄EST序列中共搜索到20687条至少含有1个SSR位点的EST序列,占EST总数的9.3％.高频率重复类型为一核苷酸、二核苷酸、三核苷酸,占EST-SSR总数的95.7％,其他重复类型仅占4.3％.其中最常见的是一核苷酸重复,其次是二核苷酸重复.从葡萄SSR分析表中筛选出25对EST-SSR引物并对52份葡萄材料进行PCR扩增,结果表明:25对EST-SSR引物在52个葡萄品种中共扩增出条带1033条,其中多态性条带为671条,多态率高达65％.采用NTSYS聚类分析法构建系统树,通过EST-SSR标记对供试品种的聚类分析结果与形态学、生物学分类结果基本一致,说明通过此方法获得的EST-SSR可以作为有效标记用于葡萄遗传多样性分析及遗传图谱构建等.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈佰鸿	甘肃农业大学园艺学院	128	886	13.0	25.0
2	毛娟	甘肃农业大学园艺学院	91	429	10.0	18.0
3	马宗桓	甘肃农业大学园艺学院	28	47	4.0	5.0
4	王萍	甘肃农业大学园艺学院	22	26	3.0	4.0
5	梁国平	甘肃农业大学园艺学院	13	7	2.0	2.0
6	卢世雄	甘肃农业大学园艺学院	10	4	1.0	1.0